中小型面粉机整个工艺分为原粮清理和制粉两部分。该量大部分工艺流程分别如下：
一、原粮清理部分流程：原粮清理部分为也称麦间，它又螺旋输送机湿法清理（安装有洗麦甩干机）和干法清理（安装有去石机进行小麦着水）两种形式供选择。毛麦先流过麦仓栅网，分离出特大杂物，如绳头、土块、石块等，然后由起立提升至卸料器，经卸料后流入筛组合清理机，分离出小麦中的大小杂质，并清理掉麦子表面扶着的泥块、麦毛、麦皮上的尘土及部分麦壳。被清理后的小麦，经过气力提升、溜筛后，进入去石机，去除小麦中的并肩石块和并肩泥块。若采用干法清理，再由起立将原粮提升至着水绞龙（安装在润麦仓上），经着水后即可进行润麦；若采用湿法清理，则去石机所清理后的原粮，再进入洗麦机的洗麦绞龙中，在绞龙的作用下，使小麦中的并肩石块和并肩泥块进一步得到分离，并洗去麦粒表面和嵌入麦沟中的泥土、农药、细菌、病毒等杂物，然后进行甩干，使小麦水分保持在13.5-14.5%之间（小麦水分的高低可通过调节着水时间来改变），末尾再提升至润麦仓进行润麦。经润麦12-24小时后，就可以将净麦提至粉间以备入磨制粉。中小型面粉机整个工作过程中，气源有风机提供，在卸料器的卸料过程中，由于气流的作用，轻杂质和灰尘也得到分离，这进一步强化了清理效果。
二、制粉流程：制粉部分也称粉间。净麦有起立输送到第一皮磨的进料斗内，研磨后，经圆筛提粉，提出的面粉进入面粉汇集管内，筛上物（麦芯、麸皮）经过诱导式接料器，由起立输送，进入第二皮磨上的刹克龙卸料器内，通过闭风器进入第二皮磨，继续进行研磨。研磨后的物料，仍有圆筛提粉，面粉进入汇集管内，筛上物（麦芯、麸皮）再进入第三皮磨上的卸料器内...依次通过第五皮磨，五皮磨上的筛上物，通过管道由起立提升至最后一道圆筛，经筛理，其筛上物就是麸皮，由起立提升卸料后，即可进行麸打包。中小型面粉机所提出的面粉，仍进入汇集管，汇集管所收集的面粉，由气流输送到面粉卸料器内，通过闭风器进行打包。